史际帆(Shi, Jifan)

发布者:孙毅 发布时间:2021-03-09 浏览次数:506


史际帆


复旦大学智能复杂体系基础理论与关键技术实验室 青年副研究员

E-mail: jfshi@fudan.edu.cn

个人主页:https://sites.google.com/view/jifan-shi/

 



个人简介:

从事计算生物学、生命复杂系统的数学理论等领域的研究,主要涉及随机模型与算法、生物体系建模与分析、复杂网络推断、临界现象分析等生物数学交叉方向课题。成果发表于 Briefings in Bioinformatics, PLoS Computational Biology, National Science Review 等学术期刊。

教育经历:

2012年9月-2018年1月 北京大学数学科学学院 计算数学 博士 (导师:李铁军 教授)

2008年9月-2012年7月 北京大学数学科学学院 信息与计算科学专业 学士

工作经历:

2022年5月至今 复旦大学 智能复杂体系基础理论与关键技术实验室 青年副研究员

2020年4月-2022年3月 东京大学国际高等研究所 神经智能国际研究机构 特任研究员

2018年4月-2020年3月 东京大学生产技术研究所 数理生命情报学研究室 特任研究员

近期代表性成果:

[1] Jifan Shi, Luonan Chen, and Kazuyuki Aihara. Embedding entropy: a nonlinear measure of dynamical causality. J. R. Soc. Interface, 19: 20210766, 2022.

[2] Jifan Shi, Kazuyuki Aihara, and Luonan Chen. Dynamics-based data science in biology. 
Natl. Sci. Rev., 8(5) nwab029, 2021.

[3] Jifan Shi, Andrew E Teschendorff, Weiyan Chen, Luonan Chen, and Tiejun Li. 
Quantifying Waddington’s epigenetic landscape: a comparison of single-cell potency measures. Brief. Bioinform., 21(1):248-261, 2020.

[4] Jifan Shi, Tiejun Li, Luonan Chen, and Kazuyuki Aihara. Quantifying pluripotency landscape of cell differentiation from scRNA-seq data by continuous birth-death process. 
PLOS Comput. Biol., 15(11): e1007488, 2019.