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信息动态
最新成果2025年1月2日,复旦大学智能复杂体系基础理论与关键技术实验室孙思琦团队最新成果发表在Nature Communications《自然·通讯》杂志。该工作得到了人体蛋白质组导航国际大科学计划、上海人工智能实验室、科技部重点研发计划和国家自然科学基金委的支持。国家蛋白质科学中心(北京)和清华大学联合培养博士凌天泽、上海人工智能实验室实习生张翔、靳智、复旦大学博士许晟为共同第一作者。常乘、孙思琦、欧阳万里为本文共同通讯作者。在蛋白质组学研究中,科学家需要解决两个核心问题:蛋白质结构预测和蛋白质序列测定。前者在AlphaFold等深度学习模型的推动下取得了革命性突破,几乎将结构预测的难题一举攻克;而后者,尤其是基于质谱技术的蛋白质测序,还缺乏类似的里程碑式进展。为了解决这一问题,我们提出了π-PrimeNovo,这是一种全新的非自回归Transformer模型,专为蛋白质测序设计。它不仅克服了现有方法在精度和速度上的局限性,还在多个生物学应用领域展现出卓越表现。蛋白质测序的重要性:解锁生命密码蛋白质是生命活动的核心执行者,几乎参与了所有重要的生物过程,包括修复组织、调节代谢、传递信
近日,复旦大学智能复杂体系基础理论与关键技术实验室孙思琦团队与香港中文大学、耶鲁大学联合团队提出了一种全新的超高速、高灵敏度的蛋白质同源物检测方法——Dense Homolog Retriever (DHR)。该方法利用蛋白质语言模型和密集检索技术,在不依赖序列比对的情况下,实现了蛋白质远程同源物的快速检测,显著提升了多序列比对(MSA)构建速度和蛋白质结构预测效率。目前,该成果相关论文Fast, sensitive detection of protein homologs using deep dense retrieval已发表于生物技术领域顶级期刊Nature Biotechnology。蛋白质同源物检测的基础与挑战蛋白质同源物检测是计算生物学中的一项基础工作,在蛋白质结构预测、生物分子功能分析、转录调控研究、系统发育重建以及生物标志物预测和药物发现等几乎所有生物序列相关研究中都发挥着重要作用。随着下一代测序技术的发展,生物序列数据库的规模不断扩大,传统的同源物检测方法在速度和灵敏度之间难以权衡,常常会遗漏远同源蛋白(即序列相似性较低但结构或功能相似的蛋白质)。这些方法中的一部
2024年8月7日下午, 2024年国际非线性科学及复杂性颁奖典礼在四川轻化工大学隆重举行,来自世界各地的顶尖学者与科研精英济济一堂。四川轻化工大学党委常委、副校长罗惠波教授主持典礼。典礼伊始,罗惠波教授向各位嘉宾和学者表达了最热烈的欢迎和最深切的感谢,他强调,非线性科学与复杂性研究在推动科技进步,应对现实复杂问题中具有关键作用。典礼上,多项重量级奖项逐一揭晓,首先颁发的是Lagrange Award,作为该领域的至高荣誉,旨在表彰长期致力于该领域研究,并作出卓越贡献的学者。俄罗斯下诺夫哥罗德应用物理研究所的Efim Pelinovsky教授,日本京都大学的Yoshisuke Ueda教授,因为在非线性物理科学领域的杰出成就而获此殊荣。希腊帕特雷大学的Anastasios Bountis教授,美国得克萨斯大学奥斯汀分校的Linda E. Reichl教授,以及德国波茨坦大学的Arkady Pikovsky教授荣获G.M. ZaslavskyAward,以表彰他们在非线性物理科学领域内取得的突破性成就。C.S. Hsu Award则是对非线性动力学与控制领域内杰出学者的最高赞誉。香港城市
研究成果
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通知公告
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学术活动
周达 教授
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吕雪梅 研究员
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Manuel Blum
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学术会议
青年论坛
论坛简介复旦大学光华青年学者论坛是学校“主动觅才、精准选才”的重要品牌活动,自2016年开始,已连续举办八届,吸引3000余名海内外优秀青年人才报名。本届论坛深入贯彻习近平总书记关于新时代人才工作的新理念新战略新举措和中央、上海市人才工作会议精神,深入实施学校“大人才战略”,聚焦延揽海内外优秀青年英才,为学校建设战略人才力量打下坚实基础,为国家、上海造就规模宏大的青年科技人才队伍做出贡献。 智能复杂系统分论坛简介复旦大学第九届光华青年学者论坛——智能复杂系统分论坛由复旦大学智能复杂体系基础理论与关键技术实验室承办,旨在为各学科领域的海内外优秀青年学者搭建学术交流平台,通过学术研讨会和人才洽谈会等形式,围绕国际学术前沿,探讨学科热点问题,促进学术交流与合作,推动学科交叉融合,为复旦人才引进计划汇聚全球英才。 诚邀具有数学、物理、人工智能、复杂系统科学、生物医学工程、计算机科学,计算神经科学、智能自动化控制等相关背景的青年科学家参加本论坛!论坛将于2024年12月中下旬-2025年1月上旬通过线上线下结合的形式举行。有关论坛详细介绍可访问网页:http://ghforum.fudan.ed
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暂无简介
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国际会议
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研讨会
INFORMATIONDATE23July —28July,2023VENUEHexi University in Zhangye,Gansu Province,ChinaThe Ninth Shanghai International Symposium on Nonlinear Sciences and Applications (Shanghai NSA’23)will be held at Hexi University in Zhangye, Gansu Province, China, from23 July to 28 July, 2023.Shanghai NSA’23is sponsored by the Shanghai Society of Nonlinear Sciences, co-sponsored by the Shanghai Center for Nonlinear Sciences, organized by the Research Institute of Intelligent Complex Systems of Fudan Universi
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2023年3月26日,由华为2012实验室理论研究部、华为上海研究院、复旦大学智能复杂体系基础理论与关键技术实验室联合举办的“复杂系统科学与创新应用研讨会”在上海成功举行。会议旨在通过对新一代复杂系统基础理论、算法技术和系统创新的深入研讨,开放探索感知、计算等重点应用领域中的复杂系统重大基础研究问题和潜在突破口。参加本次研讨会的学者和专家分别来自华为公司、中国科学院、复旦大学、同济大学、华东理工大学、上海大学、电子科技大学、上海师范大学、上海理工大学、西安交通大学等院校、科研机构及企业,从事系统科学、数学、物理学、计算机科学、控制科学和信息科学等不同领域的复杂性研究工作。此次会议吸引相关领域学者、专家及学生共计150余名。复旦大学党委书记裘新出席本次研讨会并致开幕词。裘书记强调了复杂系统科学在不同领域中的应用及其创新价值,同时感谢承办单位为学术界和产业界搭建的交流平台,并指出此次研讨会定将促进彼此之间的合作,为未来复杂系统科学的创新发展提供新的思路和方向。最后裘书记也预祝了本次研讨会取得圆满成功。在此次研讨会上,中国科学院数学与系统科学研究院郭雷院士就“系统学中的若干基本科学问题”作主
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研究成果
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通知公告
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更多通知公告
学术活动
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周达 教授
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吕雪梅 研究员
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Manuel Blum
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葛天 助理教授
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党建文化
为深入学习贯彻习近平总书记考察上海重要讲话精神,巩固拓展主题教育成果,以党建引领产学研深度融合,推动...
2024-03-20
2023年10月24日,智能复杂体系实验室教工党支部组织全体教职工参观“淮海战役支前文物展”。本次展览共展出...
2023-10-25
2023年5月30日上午九点半,智能复杂体系实验室教职工党支部组织参观位于上海市杨浦区的陈望道故居。陈望道...
2023-06-05
2022年11月21日,智能复杂体系实验室教职工党支部组织全体师生参观“奋进新时代——我们这十年成就图片展”。...
2022-11-21
10月20日下午三点,智能复杂体系实验室教职工党支部组织教职工前往复旦大学博物馆观看“人间正道是沧桑——党...
2022-10-21
凝心聚力砥砺前行10月16日上午,中国共产党第二十次全国代表大会在人民大会堂开幕。习近平代表第十九届中央...
2022-10-17